生化-三羧酸循環(huán)
記憶方法:天龍八部。
寧異戊同,二虎言平。
一同平虎,兩虎一能。
記憶前提:要熟悉每種物質(zhì)的全名,如果名字都不知道,就不要考研了。
解釋:
1,順烏頭酸這一步?jīng)]有太大意義,很多書都將這一物質(zhì)省略,所以,
口訣也沒有考慮。三羧酸循環(huán)從乙酰 CoA 與草酰乙酸結
合開始,一共經(jīng)過八個反應步驟,再回到草酰乙酸,我號稱天龍八步,記住
的話,你可以一步一步,寫出來,因為前一步的產(chǎn)物就是下
一步的原料,忘了一個環(huán)節(jié),整個都可能記不起來。
2,最初原料:乙酰 CoA 與草酰乙酸大家應該都知道,所以從第二步起,6
寧異戊同:檸檬酸,異檸檬酸,a-酮戊二酸,F(xiàn)在大家都要講究個性,干什
么都要別具一格,就叫做寧可異,也不要與人相同(為了
記憶,酮戊倒過來成了戊酮)
3,二虎言平(琥珀酰,琥珀酸,延胡索酸,蘋果酸):二虎相斗,必有一
傷,F(xiàn)在世界的主題是:和平和發(fā)展。為了人類的將來,共贏才是真理。所以,二虎相斗到最后,言平。
蘋果酸后就回到了原料之一:草酰乙酸。
4,除了能記住反應步驟外,還要記住哪里產(chǎn)H,生成co2那里生成能量。
一同平虎:異檸檬酸,a-酮戊二酸,蘋果酸脫氫反應生成 3 個 NADH+H+,琥珀酸脫氫生成1個 FADH2。山上出現(xiàn)一只吃人的老虎,所以大家一同(上山)平虎。另外,一同不光脫H,還脫了個CO2。
5,二虎一能:兩只老虎對陣,你說中間好大的能量呀。產(chǎn)生一個高能磷酸鍵。
三羧酸循環(huán)亦稱檸檬酸循環(huán)、Krebs 循環(huán)。
可以說是生物化學最重要的知識點,也是大家必須掌握和很難掌握的(至少可以說你能記住幾個月)
循環(huán)的第一步是乙酰 CoA(2C)與草酰乙酸(4C)縮合成檸檬酸(6C),
檸檬酸經(jīng)一系列反應重新生成草酰乙酸,完成一輪循環(huán)。
主要事件順序為:
(1)乙酰 CoA 與草酰乙酸結合,生成六碳的檸檬酸,放出 CoA。檸檬酸合成酶。
(2)檸檬酸先失去一個 H2O 而成順烏頭酸,再結合一個 H2O 轉(zhuǎn)化為異檸檬酸。順烏頭酸酶(省略)
(3)異檸檬酸發(fā)生脫氫、脫羧反應,生成 5 碳的 a-酮戊二酸,放出一個CO2,生成一個 NADH+H+。異檸檬酸脫氫酶
(4)a-酮戊二酸發(fā)生脫氫、脫羧反應,并和 CoA 結合,生成含高能硫鍵的
4 碳琥珀酰 CoA,放出一個 CO2,生成一個 NADH+H+。酮戊二酸
脫氫酶
(5)碳琥珀酰 CoA 脫去 CoA 和高能硫鍵,放出的能通過 GTP 轉(zhuǎn)入 ATP琥珀酰輔酶 A 合成酶
(6)琥珀酸脫氫生成延胡索酸,生成 1 分子 FADH2,琥珀酸脫氫酶
(7)延胡索酸和水化合而成蘋果酸。延胡索酸酶
(8)蘋果酸氧化脫氫,生成草酸乙酸,生成 1 分子 NADH+H+。蘋果酸7
脫氫酶
小結:
一次循環(huán),消耗一個 2 碳的乙酰 CoA,共釋放 2 分子 CO2,8 個 H,其中四個來自乙酰 CoA,另四個來自 H2O,3 個 NADH+H+,1FADH2。此外,還生成一分子 ATP。
生化-擺動現(xiàn)象
從我開始 A U C【我(I)對應 A U C】
A C 配對很正!続 對 U、C 對 G】
U G 配對多 U G【U 對 A G 正常外多了個 G】【G 對 C U 正常外多了個 U】
DNA 的雙螺旋結構的數(shù)據(jù)記憶:01234
01 是 10 對堿基。
2 是螺旋直徑 2nm。
3,4 是堿基平面的距離 0.34nm。
生化--氨基酸三字代碼
上學的時候,MEET(met)了一個笨蛋(蛋氨酸),名字叫阿丙(丙氨酸),
我(Val)是(纈氨酸)他的(His)組(組氨酸)長,告訴他無數(shù)次 Ser 不念色(色
氨酸),念絲(絲氨酸),他卻說他干(甘氨酸)不來(Gly)。無賴(賴氨酸)死(Lys)了,光(胱氨酸)說自己很有 SIZE(Cys),要來一個五光十色(色氨酸)的 TRIP(Trp),還要吃有很多 PROTEIN(Pro)的蘇(蘇氨酸)氏(Thr)果脯(脯氨酸),我就踹(Tyr 和 Try 很象)了他一腳落(酪氨酸)
起始密碼:
AUG,聯(lián)想"哎(A)喲(U)急(G)了,開始(起始)吧
生物化學 DNA 復制相關內(nèi)容
原核生物:
DNApolⅠ:具有校讀,填補,雙向外切酶活性的單鏈大分子,可延長 20 個核苷
酸.⑴小片斷:5,3 外切活性.⑵大片斷(klenow):3,5 外切活性,也是實驗的工具酶.
DNApolⅢ:具有 10 個亞基α(5,3 聚合活性),ε(3,5 外切),β(辨認引物,起滑動作用),θ(維持二聚體結構)的催化核苷酸聚合的不對稱二聚體.
DNApolⅡ:雙向外切活性.
總結:Ⅰ,Ⅱ有雙向活性,Ⅲ有 5,3 聚合和 3,5 外切活性維持拓撲構想有三:解螺旋酶(DnaB),DNA 拓撲異構酶(切開,封閉,其中Ⅱ起主要作用),單鏈 DNA 結合蛋白(不斷和 DNA 結合分離,保持單鏈完整).8DnaA 辨認起始點.DnaC 幫助 DnaB.引物酶是 dnaG 的基因產(chǎn)物.是一種 RNA 聚合酶.
引發(fā)體=引物酶+DnaB+DnaC+模板 DNA.引發(fā)體無 DnaA 是因為 DnaA
辨認之后促使 B,C 結合到 DNA 上,A 即被釋放.
滾環(huán)復制見于低等生物和染色體外的 DNA,不需要引物.
真核生物
共五種 DNA-pol.
α和δ延長作用,其中α隨從,δ領頭
ε校讀.修復
β其它無作用時才起作用
γ在線粒體內(nèi)叫 mtDNA,易突變,與衰老有關.
質(zhì)粒是染色體外的 DNA,是基因工程的常用載體.
RNA 引物由 RNA 水解酶水解,由 DNA-pol 加上.
端粒酶:是一種RNA-蛋白質(zhì).它RNA部分與DNA識別,部分作為模板逆轉(zhuǎn)錄
生成端粒,多是 TTAGGG 的重復.而不依賴與 DNA 作為模板.
、抛贤饩→嘧啶二聚體.
⑵5-溴尿嘧啶→A-G,
、橇u胺類→T-C,
、葋喯跛猁}→C-U,
⑸烷化劑:G→甲基化 G,
、淑牭敦氀:谷→纈,
⑺地中海貧血:Hb 的β→δ,重排.
、贪螂装:C-rasH 點突變,甘→谷,
、颓谐迯(UrvA 和 B 辨認結合損傷部位,urvC 切除):色性干皮病 XP 缺陷(DNApolⅠ和連接酶),
、沃亟M修復:RecA 重組蛋白
、蟂OS 修復:uvr,rec,lexA,DNA-polⅡ參與修復,修復存活的 DNA 多有突變.
逆轉(zhuǎn)錄:需 Zn,引物為病毒本身的 tRNA.
密碼子和反密碼的擺動--igacu 09 賀銀城書 234 頁按照這個順序記憶 i 對
應的正好是后三個為 acu g 對應的是后兩個 cu a 對應的是最后一個 u
生化酶學,維生素輔酶有點容易忘,又?.
鄙夷拳擊踢屁屁硫胺素焦磷酸酯TPP(踢屁屁),維生素B1(鄙夷),轉(zhuǎn)移醛基(拳擊)9
嫌貧愛富反辛酸CoA(愛富)硫辛酸(辛酸),泛酸(反+酸),轉(zhuǎn)移;(嫌)
古壁時而完歸趙鈷胺素(古),維生素B12(壁時而),轉(zhuǎn)移烷基(完)
六一奪權轉(zhuǎn)為安磷酸吡哆醛(奪權),維生素B6 的一種(六一),轉(zhuǎn)氨酶(轉(zhuǎn)為安)
一夜兩聲嘆
一夜即一碳單位和四氫葉酸,兩聲即二氧化碳和生物素
維生素PP和NAD(輔酶一),維生素B2和FAD/FMN(輔酶二),均為氧化脫氫酶輔酶,遞氫,太常遇到,應該不會記錯吧。
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