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藥物在和生物大分子作用時(shí)，一般是通過(guò)鍵合的形式進(jìn)行結(jié)合，這種鍵合形式有共價(jià)鍵和非共價(jià)鍵兩大類。
(1)共價(jià)鍵鍵合類型
共價(jià)鍵鍵合類型是一種不可逆的結(jié)合形式，和發(fā)生的有機(jī)合成反應(yīng)相類似。共價(jià)鍵鍵合類型多發(fā)生在化學(xué)治療藥物的作用機(jī)制上，例如烷化劑類抗腫瘤藥物，對(duì)DNA中鳥(niǎo)嘌呤堿基產(chǎn)生共價(jià)結(jié)合鍵，產(chǎn)生細(xì)胞毒活性。
(2)非共價(jià)鍵鍵合類型
| 鍵合類型 | 代表基團(tuán) | 代表藥物 |
| 范德華力 | 范德華引力來(lái)自于分子間暫時(shí)偶極產(chǎn)生的相互吸引 | 局部麻醉藥普魯卡因與受體的作用。 |
| 氫鍵 | O、N、S、C等原子，如：羰基、羥基、巰基、氨基，甚至有些還是帶有電荷的基團(tuán)。 | 碳酸、磺酰胺和碳酸酐酶結(jié)合。 水楊酸甲酯形成分子內(nèi)氫鍵 |
| 疏水鍵 | 藥物結(jié)構(gòu)中非極性鏈部分和生物大分子中非極性鏈部分相互作用 | |
| 電荷轉(zhuǎn)移復(fù)合物 | 富p電子的烯烴、炔烴或芳環(huán)，或含有弱酸性質(zhì)子的化合物 | 抗瘧藥氯喹 |
| 離子-偶極和偶極-偶極相互作用 | 如碳原子和N、O、S、鹵素等成鍵 | 乙酰膽堿和受體的作用 |
氫鍵是有機(jī)化學(xué)中最常見(jiàn)的一種非共價(jià)作用形式，也是藥物和生物大分子作用的最基本化學(xué)鍵合形式。范德華引力是非共價(jià)鍵鍵合方式中最弱的一種。
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