最長(zhǎng)公共子串問(wèn)題的實(shí)現(xiàn)
最長(zhǎng)公共子串問(wèn)題:一個(gè)給定序列的子序列是在該序列中刪去若干元素后得到的序列。給定兩個(gè)序列X和Y,當(dāng)另一序列Z既是X的子序列又是Y的子序列時(shí),稱Z是序列X和Y的公共子序列。最長(zhǎng)公共子串就是求給定兩個(gè)序列的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列。例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一個(gè)子序列。
問(wèn)題分析:
給定兩個(gè)序列A和B,稱序列Z是A和B的公共子序列,是指Z同是A和B的子序列。問(wèn)題要求已知兩序列A和B的最長(zhǎng)公共子序列。如采用列舉A的所有子序列,并一一檢查其是否又是B的子序列,并隨時(shí)記錄所發(fā)現(xiàn)的子序列,最終求出最長(zhǎng)公共子序列。這種方法因耗時(shí)太多而不可取。
考慮最長(zhǎng)公共子序列問(wèn)題如何分解成子問(wèn)題,設(shè)A=“a0,a1,…,am-1”,B=“b0,b1,…,bm-1”,并Z=“z0,z1,…,zk-1”為它們的最長(zhǎng)公共子序列。不難證明有以下性質(zhì):
(1) 如果am-1=bn-1,則zk-1=am-1=bn-1,且“z0,z1,…,zk-2”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-2”的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列;
(2) 如果am-1!=bn-1,則若zk-1!=am-1,蘊(yùn)涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列;
(3) 如果am-1!=bn-1,則若zk-1!=bn-1,蘊(yùn)涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列。
這樣,在找A和B的公共子序列時(shí),如有am-1=bn-1,則進(jìn)一步解決一個(gè)子問(wèn)題,找“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bm-2”的一個(gè) 最長(zhǎng)公共子序列;如果am-1!=bn-1,則要解決兩個(gè)子問(wèn)題,找出“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列 和找出“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一個(gè)最長(zhǎng)公共子序列,再取兩者中較長(zhǎng)者作為A和B的最長(zhǎng)公共子序列。
為了節(jié)約重復(fù)求相同子問(wèn)題的時(shí)間,引入一個(gè)數(shù)組,不管它們是否對(duì)最終解有用,把所有子問(wèn)題的解存于該數(shù)組中,這就是動(dòng)態(tài)規(guī)劃法所采用的基本方法,具體說(shuō)明如下。
定義c[i][j]為序列“a0,a1,…,ai-2”和“b0,b1,…,bj-1”的最長(zhǎng)公共子序列的長(zhǎng)度,計(jì)算c[i][j]可遞歸地表述如下:
(1)c[i][j] = 0 如果i=0或j=0;
(2)c[i][j] = c[i-1][j-1]+1 如果i,j>0,且a[i-1] = b[j-1];
(3)c[i][j] = max{c[i][j-1], c[i-1][j]} 如果i,j>0,且a[i-1] != b[j-1]。
按此算式可寫出計(jì)算兩個(gè)序列的最長(zhǎng)公共子序列的長(zhǎng)度函數(shù)。由于c[i][j]的產(chǎn)生僅依賴于c[i-1][j-1]、c[i-1][j]和c[i][j-1],故可以從c[m][n]開(kāi)始,跟蹤c[i][j]的產(chǎn)生過(guò)程,逆向構(gòu)造出最長(zhǎng)公共子序列。細(xì)節(jié)見(jiàn)程序。
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